La nécessité d´avoir une structure capable de gérer, traiter et diffuser toutes les informations au niveau national a conduit en 1986 à la tenue d´un atelier sur le processus gestionnaire.
Les recommandations issues de cet atelier ont donné suite la signature d’un contrat entre USAID, l’Université de Tula et le gouvernement du Niger en 1987, puis dans la même lancée un séminaire national sur le SNIS a été organisé.

Ensuite a eu lieu en 1989 la formation des formateurs sur le système d´Information Sanitaire, puis en 1992 la définition des indicateurs de santé.